Dekanu u radu pomažu prodekani. Dekan može ovlastiti jednoga od prodekana da ga zamjenjuje u zastupanju i predstavljanju Fakulteta hrvatskih studija Sveučilišta u Zagrebu. Prodekane bira i razrješava Fakultetsko vijeće na dekanov prijedlog. U odluci o izboru pobliže se određuje područje djelovanja i nadležnost prodekana. Prodekani su članovi Dekanskoga kolegija i Fakultetskoga vijeća.
Obnašatelji dužnosti prodekana Fakulteta hrvatskih studija Sveučilišta u Zagrebu:
- doc. dr. sc .Vanja Kopilaš obnašatelj dužnosti prodekana za nastavu i studente,
- izv. prof. dr. sc. Andreja Sršen obnašateljica dužnosti prodekanice za znanost
- doc. dr. sc. Vlatko Smiljanić obnašatelj dužnosti prodekana za poslovanje
Odluka o izmjeni dijela Odluke o imenovanju o. d. prodekana Fakulteta hrvatskih studija
Odluka stupa na snagu 5. lipnja 2025.