Ustrojbene jedinice Fakulteta hrvatskih studija Sveučilišta u Zagrebu jesu: 

Odsjek za demografiju i hrvatsko iseljeništvo, 
Odsjek za filozofiju i kulturologiju, 
Odsjek za komunikologiju, 
Odsjek za kroatologiju, 
Odsjek za odgojno-obrazovne znanosti, 
Odsjek za povijest, 
Odsjek za psihologiju, 
Odsjek za sociologiju, 
Znanstveni zavod, 
Centar za učenje hrvatskoga jezika, 
Knjižnica i 
Dekanat.